城市園林綠化苗木品種退化的原因主要集中于生產繁殖階段與流通應用階段。針對目前園林綠化苗木品種退化的問題，經過多年的經驗總結并結合相關的理論分析，認為主要原因包括如下方面。
　　繁殖方式單一，缺乏良種選擇當前園林綠化苗木的繁殖，特別是小喬木及亞灌木的繁殖生產主要是以無性繁殖為主，有性繁殖為輔。采用無性繁殖的目的就是為了快速增加繁殖系數，以及保持品種的某一重要特性。但過度使用這種繁殖方式會導致植物機體內相關異質物的快速減少，從而降低該品種的生活力，品種發生退化。如不斷從生長勢較旺盛的枝條上剪接穗、插條進行擴繁，而不更新復壯母本，或者選用的枝條生理年齡老化，已出現退化現象，采用該類枝條直接影響苗木的品質，引起苗木良種退化。近年來，在道路和公園綠地中大量使用的紅葉石楠和金森女貞，由于其母本采穗部位不一致和穗條生理年齡不統一，導致出現色葉生長時間不一致、色彩不一、色葉期較短等現象，從而影響了園林綠地的整體彩化效果。
　　品種病毒侵染，抗病性下降：長期采用無性繁殖的苗木品種，不斷剪穗致使植株體內病毒持續積累，而一般由于管理措施不到位，其扦插用的母本植株后期不能得到有效的復壯提純，隨著氣溫的升高，植物營養代謝活動的加強，體內病毒擴散的速度也會加快，從而加劇品種退化。同時，一個新品種的大量擴繁和推廣使用，也會加劇某些病害的發生，致品種的抗病性下降，從而喪失優良種性。如當前我國南方地區大量使用的紅花檵木、金邊黃楊和金葉女貞等灌木，其品種退化的主要原因就是由于多代扦插繁殖，所采用的扦插母本隨意性大，未建立專門的母本群體；同時，在采穗過程中，不注意重要環節的消毒和殺菌，致使病毒滋生，幼苗生長勢減弱，園林綠地內栽植后，其生物學特性很難表現出來，從而導致品種退化。
　　栽培技術和環境條件不適合品種的生長：優良的品種都是直接或者間接來源于野生種，當環境條件和栽培方法不合適，其優良種性就可能不能表現出來，長期的栽培條件下優良品種發生退化，主要表現在以下３個方面。第一，土壤改良不到位，所用的土壤理化性質不達標、土質低劣、養分肥力差，影響苗木的正常生長，進而影響植株優良性狀的體現，如茶花、梔子花等喜酸性花灌木，如土壤改良不徹底、不到位，不能達到其對于酸性土的要求，會導致植株的生長勢減弱，開花量減少，花期縮短，品種嚴重退化。第二，夏季日照強烈、水泥路面熱效應嚴重，所用的苗木如果抗逆性差，也會導致生長不良，如茶梅、杜鵑等喜陰性植物，直接種植于城市道路分車帶而在夏季又未搭建遮蔭網，植株葉片黃化枯死現象多有發生，同時整株的抗病性下降，生長勢減弱，至開花期，開花量和開花期大大降低。第三，濕度要求高的品種，如不栽植于合適的環境中，將導致生長勢減弱，無法將優良的種性表達出來，如最新應用的品種弗森虎耳，由于城市道路分車帶中的水分不足、空氣濕度低，不利于植株生長，從而造成了該品種發生秋冬季時色葉期短、春季植株生長不良、花序量少、花期短的現象，最終導致觀賞特性退化的問題。
　　修剪技術不到位，隨意性大：綠化苗木的修剪應因不同的品種而異，適當的修剪可以促進植物的生長；反之，則會破壞植物的生長與發育，降低抗病性，從而引發品種退化。部分園林綠地的修剪養護管理就存在上述問題，如江浙地區，園林中大量栽植的紫薇，植株開花結果后宜采用極重短截，在枝條基部僅保留２～３個芽，其余需全部剪除，這樣有利于翌年的開花；而現在城市的公園和道路綠地內，紫薇的蒴果未能及時修剪，從而導致植株的觀賞效果降低。此外，對于其它一些花灌木品種的修剪，未將開花枝與生長枝區分開，采取同樣的重修剪方式，直接影響了其正常生長與開花，導致植株體提前老化，發生衰退現象。